В окрестностях озера Мзы обитает типичная фауна высокогорной зоны Абхазии, где сочетаются альпийские луга, редколесье и скальные участки. Среди птиц часто встречаются клёст, альпийская завирушка, кукушка, кряква и другие виды, которые привлекаются водой и насекомыми вокруг озера Мзы.
Также в районе могут появляться перелётные птицы, использующие горные озёра как точки остановок на миграционных маршрутах.
Среди животных в окрестностях озера Мзы можно встретить мелких и средних млекопитающих: косулю, кабана, барсука, ежей, различные виды грызунов и насекомоядных. Однако крупные хищники, такие как волк или бурый медведь, появляются здесь редко, в большинстве случаев можно встретить только следы животных.
Важно помнить, что озеро Мзы находится в зоне охраняемых природных территорий, поэтому нужно соблюдать правила поведения в природе: не оставлять мусор, не охотиться и не беспокоить диких животных.